A Greenpeace és az Energiaklub szerint a hatóságok által megfogalmazott követelmények sok esetben nem számonkérhetõek, például nincsenek egyértelmû elõírások a Paks II leszerelésére, leállítására, felhagyására vonatkozóan. A Paks II beruházás környezetvédelmi hatástanulmánya emellett a civilek szerint nem ad egyértelmû választ arra, hogy 
mihez kezdene az erõmû a nukleáris hulladékkal és a kiégett fûtõelemekkel,
az erõmû hõtermelése hogy nem fogja a megengedett szint fölé melegíteni a Duna vizét, ezzel veszélyeztetve a folyó élõvilágát,
vagy hogy hogyan lennének megelõzhetõek az emberi hibára vagy szándékos károkozásra visszavezethetõ balesetek.

A szervezetek szerint a hatástanulmány alapján nem lett volna szabad megadni az engedélyeket. A Greenpeace és az Energiaklub közös közleménye szerint pedig "az atomerõmû bõvítése teljesen feleslegessé válna, ha a kormány elkezdené fejleszteni a biztonságos, tiszta és versenyképes megújuló energiaforrások hálózatát, mely Magyarország orosz energiafüggõségét is csökkenteni tudná".